Фамилия Рахматллина — вариант женской формы фамилии Рахматллин, и её разбор лучше начать с мужской основы, чтобы не запутаться в суффиксах. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я: Рахматллин значит «чей?» — сын или потомок Рахматллы. А вот само имя Рахматлла — это не что иное, как арабское Рахматулла (рахмат + улла), что переводится как «милость Аллаха». Удвоение «л» в русской записи — результат адаптации: в оригинале там долгий согласный (шадда), который на письме передают сдвоенной буквой.

Словообразовательная модель здесь классическая для тюркских и мусульманских имён, которые вошли в русский быт через татарскую, башкирскую или казахскую среду. Суффикс -ин — чисто русский, патронимический. Если бы фамилия оформлялась по тюркской модели, она звучала бы как Рахматуллин или Рахматуллаев (с суффиксом -ев, характерным для фамилий на мягкий согласный). Но здесь мы видим редкий случай: основа на «а» (Рахматлла) потребовала суффикса -ин, а не -ов. Это указывает на то, что фамилию записывали в русских документах, возможно, в волостных правлениях или при переписях, где имя воспринимали как склоняемое по типу «Никита — Никитин».

Географически фамилия Рахматллин (и, соответственно, Рахматллина) встречается в основном в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в других регионах России. Встречается она реже, чем массовые Рахматуллины, — это говорит о том, что исходное имя бытовало в локальной, возможно, диалектной форме. В некоторых говорах «Рахматлла» могло быть стяжением от «Рахматулла» — выпадение гласного «у» в потоке речи дало удобный для произношения вариант.

Сословно предки носительницы фамилии скорее всего были крестьянами или мещанами. Дворянские роды с такой основой не фиксируются, а среди духовенства (мулл и имамов) чаще встречались фамилии на -ов, образованные от полной формы имени. Так что Рахматллины — это, вероятно, потомки человека, которого в быту звали просто Рахматлла, и это прозвище закрепилось за его детьми в качестве официальной фамилии при переходе на русскую систему именования в XIX — начале XX века.