Фамилию Репченков обычно разбирают через прозвище Репка или Репчёнок. Основа здесь — слово «репа», один из главных продуктов на столе крестьянина до повсеместного распространения картофеля. В старину репу не только ели, но и использовали как меру: о круглом, плотном человеке говорили «репа», а о низкорослом и коренастом — «репка». Прозвище Репка мог получить и медлительный, флегматичный человек — по аналогии с тем, как репа «сидит» в земле.

Модель образования фамилии — патронимическая, но с двойным суффиксом. Сначала от прозвища Репка образовали отчество Репченко (с уменьшительным суффиксом -енко, характерным для украинской и южнорусской традиции), а затем к нему добавили стандартный русский суффикс принадлежности -ов. Получилось Репченков — буквально «сын Репченка» или «внук Репки». Такая цепочка нередка для фамилий, которые формировались на границе русских и украинских земель, в Курской, Воронежской, Белгородской губерниях. Там отчество на -енко сначала закрепилось как самостоятельная фамилия, а позже, при переезде в великорусские области, к ней добавили -ов, чтобы «обрусить» звучание.

Встречается и более редкая, но логичная версия: от прозвища Репчатый — человека с лицом или фигурой, напоминающими репку. В этом случае Репченков могло возникнуть напрямую от прилагательного «репчатый» через усечение основы и добавление -енков. Однако эта гипотеза менее вероятна, потому что в документах XVII–XVIII веков чаще фиксируются именно прозвища Репка и Репчёнок, а не Репчатый.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» упоминаются однокоренные образования — Репкин, Репнин, Репьев. Фамилия Репченков стоит в том же ряду, но отличается именно украинским оттенком в суффиксальной части. Найти её в древних боярских списках не удастся: это фамилия поздняя, крестьянская или однодворческая. Носители её, скорее всего, были людьми из приграничных южных уездов, где фамилии складывались позже, чем в центре России, и часто фиксировали именно бытовые прозвища.