Фамилия Роганенко образована от прозвища Роган. В основе, вероятнее всего, лежит слово «рог» — так на Руси могли назвать человека с шишкой на лбу, которую в народе именовали «рогом». Это самая простая и правдоподобная версия: прозвища по физическим особенностям давали повсеместно, и они легко закреплялись за потомками.

Есть и вторая версия, связанная с дохристианскими мирскими именами. Рог и производные от него (Рогач, Рогов, Рожон) были популярны в древней Руси. Степан Веселовский в своих ономастических трудах записал Рогова Василия Данилова, 1455 год, Дмитров, и упоминает имена Козий Рог, Турий Рог. То есть корень «рог» в личных именах и прозвищах встречался часто, и Роган мог быть одним из таких мирских имён, не связанных с внешностью, а символизирующих силу, упорство или воинственность.

Народная легенда добавляет красочную деталь: будто бы в дохристианские времена боярин Роган, проявив смекалку и талант военного стратега, основал на холме Опольского края, посреди древнего пути из Львова в Станислав, оборонительный рубеж Рогатин. Оттуда он руководил объединёнными местными славянскими племенами в борьбе с кочевниками. Прямых исторических подтверждений эта история не имеет, но она объясняет, почему имя Роган не забылось, а оставило след в топонимике — название города Рогатин действительно существует в Ивано-Франковской области Украины.

Суффикс -енко в фамилии Роганенко указывает на украинское происхождение и означает «сын» или «потомок». То есть Роганенко — буквально «сын Рогана». Такая модель образования фамилий была массовой на землях современной Украины с XVI–XVII веков, особенно среди казачества и крестьянства. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились раньше и в более широких слоях, фамилии на -енко долго оставались семейными прозвищами и окончательно оформились позже.

Интересно, что фамилия Роганенко не имеет отношения к слову «рогатый» в грубом или насмешливом смысле. Скорее, она отражает архаичную традицию называть людей по предметам окружающего мира — рог был символом плодородия, силы и защиты у многих славянских племён. Поэтому предок носителей этой фамилии мог быть и просто крепким, своенравным человеком, которого сравнивали с быком или туром.

Встречается фамилия преимущественно на Украине и в южных областях России, куда переселялись украинцы в XVIII–XIX веках. В документах она фиксируется в разных написаниях — Роганенко, Рогананко, иногда Роганенков, что отражает живую народную традицию, когда писарь записывал фамилию на слух.