Фамилия Рогожена — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, сохранив старую форму прилагательного. В современном русском языке мы бы сказали «рогожный» или «рогожаный», но в северных и центральных говорах XVII–XVIII веков форма на «-ена» была вариантом притяжательного или качественного прилагательного. Так что Рогожена — это буквально «та, что из рогожи», «рогожная», «сделанная из рогожи» или «имеющая отношение к рогоже».

Корень здесь прозрачный: рогожа — грубая ткань из лыка или мочала, которой покрывали товары, устилали полы, делали кули и мешки. Прозвище Рогожа или Рогожена мог получить человек, который торговал рогожей, плел её, возил на базар или просто носил одежду из этой дешевой ткани. В отличие от фамилий на «-ин» (Рогожин) или «-ов» (Рогожев), форма на «-ена» встречается реже и чаще фиксировалась в документах как личное прозвище, а не как устоявшаяся фамилия.

По одной из версий, Рогожена могло быть не просто прозвищем, а «уличным» именем, данным женщине — например, жене рогожника или вдове, которая сама занималась этим ремеслом. В русской ономастике такие «материнские» фамилии на «-ена» (как Солженица, Бортена) иногда указывали на жену или дочь мастера. Но чаще всего это просто вариант написания, который закрепился в конкретной местности — возможно, в Поволжье или на Русском Севере, где рогожное дело было особенно развито.

Фамилия Рогожена не перегружена спорными версиями: альтернативные толкования вроде связи с топонимом Рогожь (подмосковное село) маловероятны, потому что от таких названий обычно образуются фамилии на «-ский» (Рогожский). Так что смело можно считать, что предки носителя этой фамилии имели прямое отношение к рогоже — либо как производители, либо как торговцы, либо как люди, чей быт был неразрывно связан с этим грубым, но незаменимым материалом.