Фамилия Рубейкин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Рубейкин образована от прозвища Рубейка, которое восходит к глаголу «рубить». Возможно, Рубейкой прозвали человека, получившего рубленую рану, увечье на войне. Однако такое прозвище могли дать и столяру — по названию одного из столярных инструментов — рубанка. Кроме того, не исключено, что в основу фамилии Рубейкин легло диалектное слово «рубей» — «рубль» (монетка) или «рубель» (деревянная скалка с неровной, рельефной поверхностью для разминания кож). Таким образом, основатель рода Рубейкиных мог быть кожемякой или бережливым человеком. Менее вероятно, что прозвище Рубейка восходит к литовскому слову rubenis — «тетерев». В таком случае, такое прозвище мог получить охотник или глуховатый человек. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Рубейка, со временем получил фамилию Рубейкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Рубейкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Рубейкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.