Фамилия Руфиев — редкий пример русской фамилии, образованной от полного канонического имени, а не от его уменьшительной формы. В основе лежит мужское имя Руф, которое пришло в православные святцы из латинского языка, где rufus означает «рыжий», «красноватый». Связь с цветом волос или кожи — самое вероятное исходное значение, которое могло закрепиться за первым носителем имени.

Модель образования здесь простая и архаичная: к основе Руф- добавлен суффикс притяжательности -ев, указывающий на принадлежность. Руфиев буквально значит «сын Руфа» или «потомок Руфа». В русской ономастике такой тип фамилий (с суффиксом -ев после мягкого согласного) массово формировался в XV–XVII веках, преимущественно в среде служилых людей и крестьян центральных и северных губерний.

Имя Руф в святцах встречается несколько раз, но самым известным носителем считается апостол от семидесяти Руф, упоминаемый в Послании к Римлянам. Однако в бытовой русской традиции это имя никогда не было распространённым — оно оставалось редким, преимущественно монашеским или книжным. Соответственно, и фамилия Руфиев не получила широкого географического распространения. Она встречается точечно, чаще в старых переписях Псковской, Новгородской и Вологодской губерний, где сохранялись архаичные именные формы.

Любопытно, что фамилия могла возникнуть и в среде духовенства: семинаристы нередко получали фамилии по именам святых, особенно если их собственное родовое прозвание казалось неблагозвучным. В таком случае Руфиев — это искусственная «семинарская» фамилия, образованная по той же схеме, что и Павлов, Петров или Андреев, но от более редкого имени.

В современной России фамилия остаётся малочисленной. Её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких родов, не связанных друг с другом территориально, но объединённых общим предком, которого в крещении назвали Руфом.