Фамилия Руксин — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд, в ней просматривается типичная модель: корень «Рукс-» и суффикс принадлежности «-ин», указывающий на происхождение от отца или прозвища. Однако корень этот неочевиден, и этимологу приходится выбирать между несколькими версиями, ни одна из которых не является абсолютно доказанной.

Самый вероятный путь — связь с древнерусским нецерковным именем или прозвищем Рукса. В основе, скорее всего, лежит слово «рука». В русских говорах «рукса» могло означать «рукавица» или «тот, кто работает руками», а в переносном смысле — ловкого, умелого человека. Не исключено, что прозвище давали человеку с какой-то заметной особенностью рук, например, с большой кистью или необычной хваткой. Модель образования здесь та же, что и в фамилиях Ручкин, Рукавицын, но с более редким суффиксальным оформлением.

Альтернативная версия отсылает к географическим названиям. В псковских и новгородских землях встречаются топонимы Рукса, Руксово. В этом случае фамилия могла возникнуть как указание на выходца из такой местности: «Руксин» — сын человека из Руксы. Этот вариант менее типичен для русских фамилий на -ин, которые чаще образуются от личных имён, но полностью его исключать нельзя, учитывая распространённость подобных моделей на северо-западе Руси.

Третья, более спорная гипотеза, выводит корень из тюркских языков, где «рукс» может означать «светлый», «сияющий». Но для её подтверждения нет ни исторических записей, ни массового бытования фамилии в регионах с тюркским субстратом. Поэтому эту версию стоит рассматривать лишь как экзотическую, без серьёзных оснований.

Суффикс «-ин» указывает, что фамилия Руксин сформировалась в среде, где отчество или прозвище отца передавалось сыну в притяжательной форме. Это характерно для центральных и северных областей России. Фамилия не относится к числу частых, но встречается в разных регионах, что говорит о множественных, независимых очагах её возникновения. Скорее всего, предки носителей фамилии Руксин были простыми людьми — крестьянами или ремесленниками, чьё прозвище закрепилось за родом.