Фамилия Рукшин образована от прозвища Рукша, которое восходит к литовскому глаголу rukti. На русский язык он переводится как «дымить». Вполне вероятно, что прозвище Рукша указывало на привычки основатель рода: он был заядлым курильщиком. Не исключено, что это прозвище этимологически связана со словом rukas, т.е. Возможно, что предок обладателя данной фамилии был довольно скрытным, неразговорчивым человеком, предпочитающим шумной компании уединение. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Рукша, со временем получил фамилию Рукшин.