Фамилия Рупов — редкий пример, где корень слова не бросается в глаза, а суффикс не оставляет сомнений в происхождении. Модель образования здесь классическая для русских фамилий: основа + патронимический суффикс -ов. Это значит, что в основе лежало личное имя или прозвище предка — Руп.

Что могло значить это имя? Самый прямой путь ведёт к слову «руп» — в некоторых русских говорах так называли грубую, толстую ткань, мешковину, рогожу. Прозвище Руп могли дать торговцу такой тканью, портному, работавшему с грубым материалом, или просто человеку, который носил одежду из неё. В этом случае фамилия Рупов — «сын Рупа», то есть потомок человека, связанного с производством или продажей рогожи.

Есть и альтернативная, менее очевидная версия. В псковских и новгородских диалектах «руп» могло означать «обрыв», «крутой берег» или «яма». Тогда прозвище Руп давали человеку, жившему у такого обрыва или оврага. Эта гипотеза слабее: прозвища по месту жительства обычно образовывались с помощью суффиксов -ский/-цкий (Руповский), а не усечённой основы.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России и к Уралу — регионам, где были сильны староверческие общины и бытовала диалектная лексика. Встречается она нечасто, что делает её ценной для тех, кто ищет свои корни: чем реже фамилия, тем меньше шансов запутаться в однофамильцах. Скорее всего, предки Руповых были либо ремесленниками-ткачами, либо крестьянами, чьё прозвище закрепилось в официальном документе при переписи или рекрутском наборе.