Фамилия Рустемханова — редкий пример двойного восточного имени, превратившегося в наследственное родовое имя. Её основа — составное личное имя Рустемхан, которое соединяет два компонента: иранское «Рустем» (из эпоса «Шахнаме» — богатырь, силач) и тюркское «хан» (властитель, правитель). Такие сдвоенные имена (Рустемхан, Алихан, Ахметхан) были распространены у народов, где смешались иранские и тюркские традиции, — у татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии. Суффикс «-ов» (в женском варианте «-ова») — типичный русский патронимический формант, который добавили при оформлении фамилии в официальных документах, чаще всего в XIX–XX веках. Таким образом, буквальное значение фамилии — «принадлежащая потомку Рустемхана».

Примечательно, что фамилия сохранила полную форму имени-основы, а не сократилась до односложного корня, как это нередко бывает в русских фамилиях тюркского происхождения. Это указывает на сравнительно позднее закрепление — скорее всего, в советское время, когда паспортизация фиксировала имя отца целиком. Социально предки носительницы фамилии могли быть из среды мусульманского духовенства, торговцев или зажиточных крестьян, где было принято давать детям составные имена с титулом «хан» (не обязательно означавшим реальную власть — скорее пожелание достоинства и уважения).

Географически фамилия Рустемханова встречается в нескольких регионах России и постсоветского пространства, но заметно чаще — в Татарстане, Башкортостане, Дагестане и среди казахской диаспоры. В русскоязычной среде она остаётся крайне редкой, что делает её хорошим маркером этнического и культурного происхождения. Ошибочно считать, что «хан» в фамилии обязательно указывает на знатное происхождение: в народной ономастике этот компонент часто был просто частью имени, пожеланием или данью традиции, а не свидетельством родства с правителями.