Фамилия Саиков — одна из тех, где на первый взгляд прозрачная основа оборачивается неожиданным выбором между тюркским и славянским следами. В ней работает простая модель: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а значит, в основе лежит личное имя или прозвище Саик.

Самый прямой путь — от тюркского имени Саит или Саид (араб. «счастливый», «господин»), которое через диалектное произношение или уменьшительную форму могло превратиться в Саик. В русских говорах иноязычные имена нередко усекали: Саид → Сая → Саик, отсюда и фамилия. Подкрепил бы эту версию словарь Б. Унбегауна, где он разбирает адаптацию восточных имен в русских фамилиях Поволжья и Приуралья.

Но есть и другой вариант, более редкий и местный. В северных и сибирских говорах «саик» — это прозвище человека, который «сает», то есть шумит, кричит, суетится без толку. Глагол «саить» фиксируется в диалектных словарях (например, в архангельских говорах). Если так, то Саиков — потомок шумливого или суетливого предка. Версия правдоподобна, но уступает первой по распространённости: фамилия чаще встречается в татарской и башкирской среде, чем в чисто русских регионах.

Запись фамилии устойчива: без вариантов вроде Саёков или Саиков — только через «аи». Это косвенно указывает на книжное закрепление формы, а не на народное произношение. В метрических книгах XIX века по Оренбургской и Уфимской губерниям фамилия встречается у крестьян и мещан, что говорит о её бытовании в разночинной среде, без привязки к дворянству или духовенству.