Фамилия Саканова — женская форма, а её мужской вариант — Саканов. В основе фамилии лежит тюркское мужское имя Сакан. Имя это не слишком распространённое, но встречается у нескольких тюркских народов, в первую очередь у татар, башкир и казахов. Скорее всего, оно восходит к древнетюркскому слову «сак» — «осторожный, бдительный», либо к имени Сака, которое могло быть прозвищем от названия племени саков (скифских кочевников Средней Азии). Вторая версия менее вероятна, но полностью исключать её нельзя: фамилии, образованные от этнонимов, встречаются в тюркской среде.

Фамилия образована по типичной для тюркских языков модели: к основе имени добавляется притяжательный аффикс «-ан» (Сакан — буквально «принадлежащий Саку» или «Сакин сын»), а затем русский суффикс «-ов/-ова», который фамилия получила при русификации. Такая модель характерна для многих татарских и башкирских фамилий, которые в XIX–XX веках адаптировались к русской патронимической системе.

Географически фамилия Саканова чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — регионах с традиционно сильным татаро-башкирским населением. Встречается она и у казахов, особенно в Западном Казахстане, где имя Сакан бытовало как самостоятельное. В русском контексте фамилия Саканов/Саканова — редкая, её носителей немного, что говорит о её локальном происхождении: вероятно, она пошла от одного рода или селения.

Если говорить о социальном контексте, то в татарской и башкирской среде фамилии на «-ов» обычно получали незнатные люди — крестьяне, ремесленники, торговцы. Дворянские роды чаще оформляли фамилии через суффиксы «-ский» или «-ев». Так что предки современных Сакановых, скорее всего, были простыми людьми: земледельцами, скотоводами или мелкими торговцами.