Фамилия Сакардина — женская форма, за которой почти наверняка стоит мужское Сакардин. Редкая, неочевидная по корню, и это как раз тот случай, когда разбор суффикса и география подсказывают больше, чем лежащее на поверхности слово.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Сакардин — «сын Сакарды» или «человек из дома Сакарды». Такая модель типична для северных и восточнорусских земель, где фамилии на -ин так же распространены, как на -ов в центральной России. Основа же — Сакарда — не встречается в святцах и не похожа на каноническое имя. Значит, перед нами прозвище.

Здесь возможны две версии. Первая — диалектная. В рязанских и тамбовских говорах «сакарда» или «сакардина» могло означать нечто мелкое, неказистое, вроде заскорузлой корки или щепки. Человека могли так прозвать за сухощавость, невзрачный вид или привычку цепляться к мелочам. Вторая версия — топонимическая. На юге России и Украине встречаются названия урочищ и балок с корнем «сакар-» (например, балка Сакарка в Ростовской области). Фамилия могла закрепиться за выходцем из такого места — «сакардинский» со временем сократили до Сакардин.

В пользу первой версии говорит то, что прозвищные фамилии на -ин в крестьянской среде были обычным делом. В пользу второй — то, что фамилия Сакардин (и Сакардина) встречается в основном на юге России и в Поволжье, где следы тюркских или иранских топонимов не редкость. Спорный момент: прямо сейчас по открытым базам данных носителей фамилии мало, что подтверждает её редкость и узколокальное происхождение.

Однокоренных фамилий практически нет. Сакардин не смешивается с Сакаровым (от Савва) или Сакаевым (тюркское имя). Это самостоятельная, плохо изученная единица. Если у вас фамилия Сакардина, скорее всего, ваши предки жили в чернозёмной полосе или на Дону, и прозвище им дали по внешней черте либо по месту жительства. Точнее сказать трудно — без архивов конкретного села этимология остаётся в зоне догадок.