Фамилия Самотина — женская форма фамилии Самотин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем. В основе лежит слово «самота», которое в русских говорах имело несколько значений. В одних регионах «самотой» называли одиночество, уединённую жизнь, в других — самого себя, собственную персону. Соответственно, прозвище Самота могли дать человеку нелюдимому, замкнутому, либо, наоборот, тому, кто постоянно подчёркивал свою самостоятельность и независимость.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: основа «Самот-» плюс суффикс «-ин». По правилам русской фамильной системы суффикс -ин добавляется к основам, оканчивающимся на -а, -я. Таким образом, Самотин буквально означает «сын Самоты» или «человек из семьи Самоты». Фамилия образована по той же модели, что и, например, Путятин (от Путята) или Ширятин (от Ширята), только здесь основа короче и без дополнительного суффикса.

Встречается фамилия Самотин (и Самотина) преимущественно в центральных и северных областях России, что характерно для фамилий на -ин, возникших в среде крестьянства и посадских людей. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян с таким прозвищем в Вологодской и Архангельской губерниях. Это говорит о том, что фамилия не относится к числу дворянских или «книжных» — она возникла в народной среде как бытовое прозвище.

Интересная деталь: в некоторых говорах слово «самота» имело ещё одно значение — «своеволие», «упрямство». Так что предок-носитель фамилии мог быть не просто одиночкой, а человеком с крутым нравом, который всё делал по-своему. В любом случае, Самотина — фамилия, прямо указывающая на личную характеристику человека, а не на его ремесло или место жительства. Это делает её типичным примером «прозвищной» фамилии, где за каждым корнем стоит живая черта характера.