Мужское крестильное имя Самсон имеет древнееврейское происхождение и в переводе на русский язык означает «солнечный». Скорее всего, основатель рода Самсониковых был представителем привилегированного сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Самсон, со временем получил фамилию Самсоникова.