Фамилия Самсонникова образована от православного крестильного имени Самсон, которое в переводе с древнееврейского означает «солнечный». Это имя носил ветхозаветный герой, чья сила, по преданию, заключалась в волосах, и оно было широко распространено на Руси после крещения. Однако в основе фамилии лежит не само имя, а его уменьшительная форма — Самсонник. Такие «домашние» варианты имен (Самсонка, Самсоня, Самсончик) были в ходу в крестьянской и купеческой среде, где полное имя звучало слишком торжественно.

Суффикс -ник в основе указывает на то, что прозвище Самсонник могло закрепиться за человеком не только как ласкательное обращение, но и как указание на его характер. В народной традиции Самсонником нередко называли рослого, сильного мужчину, «богатыря», — так имя библейского силача переосмыслялось в бытовой речи. Впрочем, более вероятно, что фамилия просто фиксирует отчество: Самсонников — сын Самсонника, то есть потомок человека, которого в семье звали уменьшительно.

Фамилия Самсонникова — форма женского рода, принадлежащая жене или дочери Самсонникова. Мужской вариант, Самсонников, встречается в документах с XVII века, когда отчества на -ов/-ев окончательно закрепились как наследственные фамилии. Географически фамилия тяготеет к центральным и поволжским губерниям России, где имя Самсон было особенно любимо среди старообрядцев, ценивших ветхозаветные имена.

Стоит отличать эту фамилию от более распространенной Самсоновой. Если Самсонов — прямое отчество от полного имени, то Самсонников указывает на промежуточную уменьшительную форму, что делает её более «домашней» по происхождению. В переписях XIX века носители фамилии встречались среди государственных крестьян и мещан, то есть фамилия не была дворянской, но и не потерялась в простонародье.

Сегодня фамилия Самсонникова остается сравнительно редкой. Её носители, как и их предки, могут считать себя потомками человека, которого нарекли в честь «солнечного» героя, но в повседневной жизни звали просто Самсонником — коротко, по-свойски, с теплотой.