Фамилия Самукина — женская форма, мужской вариант — Самукин. В основе лежит неканоническое имя или прозвище Самука. Чтобы понять, откуда оно взялось, стоит присмотреться к суффиксу -ук-: в русских фамилиях он встречается реже, чем -ов или -ин, и часто указывает на западнорусское или украинское происхождение. В украинском языке суффикс -ук/-юк образует фамилии от личных имён: скажем, Иван — Иванюк, Павел — Павлюк. Самука, вероятно, производное от имени Самуил или Самуйло (просторечная форма Самуила). Тогда Самукин — «сын Самуки», то есть потомок человека, которого в быту звали сокращённо Самука.

Есть и другая версия, менее очевидная. В южнорусских говорах «самука» могло быть прозвищем для нелюдимого, замкнутого человека — от слова «сам» в значении «один». Сравните: «самотный» (одинокий), «самук» (отшельник). Но эта гипотеза слабее: фамилии на -ук- от прозвищ с таким корнем почти не встречаются в документах. Правдоподобнее всё-таки связь с крестильным именем.

География фамилии Самукина сегодня размыта, но если смотреть на старые переписи, фамилия чаще встречается в регионах, граничащих с Украиной: в Курской, Белгородской, Воронежской областях. Там форма на -ук- была обычной для крестьянских фамилий. В центральной России Самукиных почти нет — там преобладают фамилии на -ов и -ин от тех же имён (Самуилов, Самулин). Так что по фамилии можно предположить, что предки носительницы жили на юго-западе, возможно, были вольными или помещичьими крестьянами, а имя Самуил в их роду передавалось через поколения.