Фамилия Самусейко звучит на украинский или белорусский лад: суффикс -ейко характерен для западнорусских земель, особенно для Гродненщины, Волыни и Подляшья. В польской ономастике этот формант тоже встречается, но в украинской и белорусской традиции он чаще указывает на уменьшительно-ласкательную форму имени или прозвища. Если бы фамилия была русской, она скорее получила бы суффикс -ов или -ин, а здесь работает модель, типичная для фамилий на -ко, -ейко, -енко.

Основа фамилии — Самус. Это краткая форма от имени Самуил (библейское имя, означающее «услышанный Богом»). В народной речи имя Самуил превращалось в Самусь, Самус, а уже от этих форм образовывали фамилии. Суффикс -ейко добавляет оттенок принадлежности или уменьшительности: Самусейко буквально означает «маленький Самус» или «сын Самуса». Такой способ словообразования — типичная «полуотчество»: фамилия закрепилась за потомком человека, которого в быту звали Самусом.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с польским словом «sam» (сам) или прозвищем Самусь, которое могло означать самостоятельного, независимого человека. Однако библейское происхождение надёжнее: в метрических книгах западнорусских губерний имя Самуил нередко записывали как Самусь, и фамилии на -ейко от него — не редкость.

Социально фамилия Самусейко, скорее всего, принадлежала крестьянам или мещанам. В шляхетской среде предпочитали фамилии на -ский, а простые люди чаще получали фамилии по отцу с суффиксами -енко, -ейко. Встречается она и сегодня преимущественно в Беларуси и на западе Украины, реже — в Польше среди потомков православного населения.

Если искать однокоренные фамилии, то это Самусь, Самусенко, Самусевич, Самуйлов. Все они восходят к одному имени-источнику, но различаются суффиксами, указывающими на регион: -ейко — запад, -енко — центр и восток Украины, -евич — белорусско-польская зона.