Фамилия Самуся — яркий пример того, как украинское имя или прозвище превратилось в фамилию с помощью уменьшительно-ласкательного суффикса. В основе лежит имя Самусь — народная форма крестильного имени Самуил, которое в переводе с древнееврейского означает «услышанный Богом». Суффикс -я в украинских фамилиях (как и в русских с -я) часто указывает на прозвищное происхождение или на то, что фамилия закрепилась в среде казачества и крестьянства. Таким образом, Самуся — это «маленький Самусь» или «сын Самуся», то есть человек, чей отец или дед носил имя Самуил.

География фамилии почти целиком украинская. Наибольшая концентрация носителей — в центральных и западных областях: Винницкой, Житомирской, Хмельницкой, а также в Полтавской. В России фамилия встречается редко и, скорее всего, занесена переселенцами из Украины. Интересно, что окончание -я нередко встречается в фамилиях белорусского и польского происхождения, но для Самуся украинский контекст первичен.

В отличие от фамилий с патронимическими суффиксами -енко или -ук, модель на -я (Самуся) — более архаичная, она отражает древнюю традицию называть человека по имени отца в уменьшительной форме. В реестрах Запорожской Сечи можно встретить казаков с подобными прозвищами, но документальных подтверждений для конкретного рода Самуся нет — фамилия осела в быту, а не в канцелярии.

В написании фамилии возможны варианты: Самуся (с ударением на второй слог) и реже — Самуся (с ударением на первый). Второй вариант чаще встречается в южных говорах, где аканье влияет на произношение. В документах XIX века можно найти запись «Самусь» как самостоятельную фамилию, а «Самуся» — как её производную, закрепившуюся в конкретной семье.

Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казацкой. Фамилия не указывает на дворянство или духовенство — её носители были людьми свободных или зависимых сословий, живших на территории Малороссии. В некоторых случаях фамилия могла возникнуть от прозвища, данного человеку с именем Самуил, но в уменьшительной форме — так называли в быту, и это прозвище перешло к детям.