Фамилия Санкеев — редкий случай, когда основа ясна, а вот её значение неочевидно. Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: фамилия образована от имени или прозвища предка, которое заканчивалось на -ей или мягкий согласный. В данном случае — от имени Санкей.

Корень Санк- заставляет искать ответ в тюркских языках. Наиболее правдоподобная версия восходит к тюркскому санкы (или санк) — «остриё», «жало», «колющее оружие». В этом случае Санкей — прозвище острого на язык человека, мастера по изготовлению наконечников или просто колючего по характеру. В тюркской ономастике такие прозвища-имена были распространены: они давались без негативного оттенка, скорее как характеристика.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с татарским сан (санк) в значении «почёт», «достоинство» или «число». Тогда Санкей могло означать «почётный» или «счётный» (например, сборщик податей). Однако фонетически форма Санкей ближе к «острию», чем к «почёту».

Географически фамилия тяготеет к юго-востоку России и Поволжью — регионам, где веками шло смешение славянского и тюркского населения. Встречается она нечасто, и это говорит о том, что прозвище не превратилось в массовое имя. Носители фамилии — потомки, скорее всего, служилых людей или крестьян, получивших фамилию по отцу, которого в быту звали Санкеем.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В разных семьях говорят и Санке́ев, и Са́нкеев. Первый вариант (с ударением на второй слог) типичен для русских фамилий тюркского происхождения, второй — для тех, кто сохранил память об ударении на первый слог в исходном имени.