Фамилия Сапухина — женская форма фамилии Сапухин, а та, в свою очередь, образована от прозвища Сапуха. Основа здесь — диалектное слово «сапа» или «сапка». В южнорусских и украинских говорах «сапой» называли мотыгу, тяпку для прополки, а «сапухой» — либо саму эту работу, либо человека, который ею занимается. Таким образом, первый носитель фамилии с большой вероятностью был земледельцем или огородником — человеком, который обрабатывал землю вручную, «сапал» (полол) грядки.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей сын?» — «Сапухин»). Интересно, что фамилия эта редкая и имеет чёткую географическую привязку: основная масса Сапухиных исторически фиксируется в Курской, Воронежской и Белгородской областях, а также на востоке Украины (Сумщина, Харьковщина). Это как раз те регионы, где слово «сапа» в значении «мотыга» было в ходу, а огородничество составляло основу крестьянского хозяйства.

Версия о происхождении от неканонического имени Сапуха (как уменьшительного от Савва или Савелий) менее убедительна: такая форма не встречается в исторических документах, в отличие от прозвищ по роду занятий. Фамилия не имеет отношения к «сапуну» (лошади с одышкой) или «сапу» (скрытому подкопу) — эти значения либо узкотерминологические, либо поздние. Перед нами яркий пример «профессиональной» фамилии, которая прямо говорит о занятии предка: он был пахарем, огородником, человеком, чей труд был связан с тяжёлой ручной обработкой земли.