Фамилия Сайфидинова — женская форма фамилии Сайфидинов, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа фамилии — арабское мужское имя Сайфиддин (встречается также написание Сайфутдин, Сайфетдин). Оно составное: «сайф» переводится как «меч», а «ддин» (или «дин») — «вера», «религия». Вместе имя означает «меч веры» или «меч религии». Это типичное для мусульманского мира теофорное имя, то есть имя, прославляющее религию через образ оружия — защитника веры.

Фамилия образована по русской патронимической модели с помощью суффикса -ов. В тюркских языках, в том числе в татарском и башкирском, отчества и фамилии нередко оформляли по русскому образцу после вхождения регионов в состав Российской империи. Суффикс -ин в данном случае не используется, потому что основа имени оканчивается на согласный (Сайфиддин), а не на -а или -я. Таким образом, Сайфидинов — буквально «сын Сайфиддина» или «потомок Сайфиддина».

Фамилия распространена главным образом среди татар, башкир, а также у народов Северного Кавказа (особенно у ингушей и чеченцев), где исламские имена также популярны. В русской среде она встречается редко и почти всегда указывает на мусульманские корни предков. Интересная деталь: в некоторых диалектах татарского языка имя могло звучать как Сайфетдин, поэтому в документах XIX — начала XX века встречаются варианты Сайфетдинов, Сайфутдинов. Все они восходят к одному арабскому прототипу, а разница в написании — следствие местных произносительных норм и работы писцов при записи в метрические книги.

Сословно носители фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами, но среди татарского купечества и духовенства это имя тоже встречалось. В словаре тюркских фамилий можно найти указание, что имя Сайфиддин давали мальчикам в семьях, где хотели подчеркнуть религиозную преданность, — это не редкое, но и не массовое имя. Фамилия Сайфидинова, таким образом, несёт в себе память о предке, которого нарекли в честь «меча ислама», что было распространённой практикой в мусульманских обществах Поволжья и Кавказа.