Фамилия Сайгинурова — редкий случай, когда географическая привязка и этнический фон перевешивают морфологический разбор. Это женская форма, а мужская — Сайгинуров. Перед нами типичная патронимическая фамилия тюркского происхождения, образованная по русской модели притяжательного прилагательного с суффиксом -ов/-ев. Основа — мужское имя Сайгинур, которое бытовало у башкир и татар.

Имя Сайгинур составное, из двух корней. Первый — «сайги» (вариант «сайкы» или «сайгы») в тюркских языках означает «избранный», «отборный», «чистый». Второй — «нур» (арабское заимствование) — «свет», «сияние», один из эпитетов Аллаха в исламской традиции. Таким образом, Сайгинур переводится как «Избранный свет» или «Чистое сияние». Подобные теофорные имена с компонентом «нур» (Гайнур, Зиннур, Фаннур) широко распространены в Башкортостане и Татарстане.

Словообразовательная модель проста: к имени Сайгинур добавили русский патронимический суффикс -ов (по-татарски или по-башкирски отчество звучало бы иначе — Сайгинур улы), затем образовали женскую форму с окончанием -а. Это говорит о том, что фамилия фиксировалась в русскоязычной документации, скорее всего, после ревизий или переписей XIX века, когда оседлые тюркские народы Урало-Поволжья массово получали фамилии по отцу.

В отличие от многих русских фамилий, у Сайгинуровой нет прозвищной основы — ремесла, внешности или характера предка. Основа — сугубо личное имя, указывающее на религиозную и культурную среду: ислам с его культом света (нур) и тюркское представление об избранности. Фамилия почти не встречается за пределами Башкортостана и соседних регионов (Оренбургская, Челябинская области), что делает её маркером локальной башкирской или татарской родословной.

Из-за редкости фамилия сохранила исходное написание без искажений — в ней нет диалектных вариантов вроде Сайгинуров, Сайгынуров или Сайгинурова. Встречаются единичные случаи ударения на второй слог (Сайги́нурова), но нормативным для тюркских заимствований считается ударение на последний слог основы — Сайгинуро́ва.