Фамилия Сайназаров — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркское имя скрестилось с русским патронимическим суффиксом. В основе лежит мужское имя Сайназар, которое в свою очередь составное: «сай» (тюрк. «чистый», «отборный», «лучший») и «назар» (арабское «взгляд», «милость», «божественное внимание»). Получается что-то вроде «чистый взглядом» или «отмеченный милостью». В исламской традиции имя Назар часто давали с пожеланием, чтобы ребёнок был под защитой Всевышнего, а добавка «сай» усиливает значение — «избранный под защитой».

Суффикс «-ов» указывает на то, что фамилия сложилась в русской языковой среде, скорее всего, в XIX веке, когда при переписях и учёте крещёных или просто оседавших на русских землях тюркских народов их имена русифицировали по стандартной модели: имя отца + «-ов». Носители фамилии Сайназаров — выходцы из тюркоязычных регионов: Башкортостана, Татарстана, Средней Азии. Встречается она и у казахов, и у башкир, и у татар, но написание с «-ов» характерно именно для тех, кто попал в российскую паспортную систему.

Любопытно, что в самой тюркской среде фамилия могла бы звучать как Сайназар (без суффикса) или Сайназаров — второй вариант закрепился именно в русском документообороте. Если предки носили её, то, скорее всего, они были крестьянами или мелкими торговцами: титулованных родов с такой фамилией в дворянских списках нет. Это не «княжеская» фамилия, а бытовая, народная — от имени, которое давали простым людям.

Встречаются варианты написания: Сайназаров, Сайнозаров (с буквой «о» под влиянием аканья), а также Сайнозаров. Но исходная форма — через «а» в корне. В целом фамилия говорит о том, что предок нынешних носителей был человеком, которого окружающие считали «чистым» или «благословенным», а сама фамилия прочно связана с исламской культурой Поволжья и Центральной Азии.