Фамилия Себельдина образована от прозвища или имени, которое легло в основу мужской формы Себельдин. Корень здесь неочевиден, и этимология открывает сразу несколько путей, каждый из которых по-своему объясняет происхождение рода.

Наиболее конкретная версия связывает фамилию с географией. Прозвище Себельдин, от которого пошла фамилия, скорее всего, указывает на выходца из деревни Себельда, что стоит в Лебедянском районе Липецкой области. Такая модель — называть человека по месту, откуда он пришёл, — одна из древнейших в русской ономастике. Сам топоним Себельда, предположительно, восходит к слову «себель»: в некоторых украинских и русских говорах так называли уклейку, мелкую рыбу семейства карповых. Если это так, то название деревни могло возникнуть из-за обилия этой рыбы в местной реке, а основатель рода Себельдиных был просто человеком, перебравшимся на новое место и получившим прозвище по прежнему жительству.

Вторая гипотеза уводит в тюркскую среду. Согласно ей, фамилия ведёт начало от восточного имени Себельди (или Себельды). Это имя составное: от татарских слов «сев» — «любить» и «бельды» — «знал». Буквально его можно перевести как «знал любовь» или «познавший любовь». Такие двухосновные имена с глагольной второй частью типичны для тюркской антропонимии, и версия выглядит правдоподобной для южнорусских регионов, где татарское влияние было сильным.

Есть и третье, более экзотическое толкование: имя Себельди возводят к арабскому «сабиль» — «дорога». Тогда имя могло бы означать «родившийся в дороге». Однако эта версия слабее предыдущих: она требует цепочки фонетических допущений и не подкреплена бытовой логикой прозвищ.

Что касается суффикса, фамилия Себельдина построена по стандартной русской модели: к основе на согласный добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Себельдин). Женская форма на -а — естественное грамматическое следствие. Такая модель характерна для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на согласный, и она же говорит о том, что фамилия сложилась в среде, где преобладал русский язык.

Наиболее вероятной представляется первая версия — топонимическая. Она проще и не требует допущений о заимствовании личного имени. Тюркская гипотеза тоже имеет право на жизнь, но ей не хватает документальных подтверждений, а арабская выглядит надуманной. В любом случае, фамилия Себельдина — редкая и локальная, она прочно привязана к южнорусским землям, и её носители, скорее всего, происходят из одного небольшого региона.