Фамилия Седко — один из тех редких случаев, когда читателю стоит сразу посмотреть на географию, а не на корень. Если вы встретили Седко на юге России или в Беларуси, это, скорее всего, украинская или белорусская фамилия, образованная от имени Седко. Если же носитель родом с северо-запада (например, из Псковской или Новгородской области), перед нами может быть вариант фамилии Седков, где конечное -о — это застывшая форма древненовгородского говора (так называемый «вторичный именительный падеж»). В таких говорах фамилии на -ов могли звучать как Седко, а не Седков, и это не редкость для тамошних писцовых книг XVI–XVII веков.

Основа у фамилии прозрачная: в её сердцевине лежит имя Седко — уменьшительная форма от славянского имени Седослав или, что вероятнее, от прозвищного имени Седой. Седой в старину означало не только цвет волос, но и возраст, опытность, а иногда и просто внешнюю примету. Уменьшительный суффикс -к- в древнерусских именах был нейтральным и очень распространённым: так из полного имени делали домашнее, обиходное. Сравните: Иван — Иванко, Пётр — Петрусько, Седой — Седко.

Менее правдоподобная, но встречающаяся в любительских генеалогиях версия связывает фамилию с польским словом «siadko» (седло) или с глаголом «сесть». Но эта гипотеза слабая: в польской ономастике суффикс -ко характерен для восточнославянских территорий, а не для исконно польских фамилий. К тому же в западнорусских землях и в Речи Посполитой фамилии на -ко (Седко, Сенько, Васько) были типичны для крестьян и мещан — то есть людей, чьи предки не имели наследственного дворянского прозвания, а носили уличное или отчество в форме краткого имени.

В современных российских архивах фамилия Седко встречается редко и локально. Если отбросить единичные случаи, основная масса носителей живёт в Брянской, Смоленской областях и в Краснодарском крае — туда фамилию могли принести переселенцы с Украины в XIX–XX веках. В украинских метрических книгах Седко фигурирует как обычная фамилия казацкого или крестьянского сословия, без привязки к какому-то одному роду.