Фамилия Секаева — женская форма, образованная от мужской Секаев. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Секай. Слово «секай» в русских говорах имело несколько значений, и чтобы понять, какое из них дало фамилию, нужно смотреть на регион и контекст.

Самая вероятная версия — происхождение от глагола «сечь». Секаем в старину называли человека резкого, прямолинейного, который «сечёт правду-матку», не выбирая выражений. В северных и сибирских говорах «секач» — это ещё и кабан-самец, а «секай» могло быть прозвищем драчуна или задиры. Но есть и другая, более спокойная линия: в некоторых диалектах «секать» означало «понимать, смекать». Тогда Секай — человек сметливый, сообразительный.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели с суффиксом -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный или на -й. Модель «прозвище + -ев» типична для русских фамилий XVI–XVII веков, когда крестьян и посадских людей записывали по отцу: «Ивашко Секаев сын» означало, что отца звали Секай. Суффикс указывает на русское, а не украинское или белорусское происхождение — там чаще встречается -енко или -ук.

Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале, особенно в Оренбургской и Самарской областях. Это косвенно подтверждает версию с диалектным «секать» — в этих краях слово бытовало активно. Встречаются также варианты написания с одной «е» — Секаев, но это одна и та же фамилия, просто разное отражение произношения на письме.

В редких случаях нельзя исключать тюркскую основу. В татарском и башкирском языках есть корень «сик» (граница, рубеж), от которого могли образовать прозвище Секәй. Но для фамилии Секаева эта версия менее убедительна: тюркские фамилии в русской среде обычно получали суффикс -ов, а не -ев, и звучали бы как Секаков или Секаев с ударением на последний слог. Ударение же в фамилии Секаева, как правило, падает на второй слог — Сека́ева, что характерно для русской модели от прозвищ на -ай/-яй.