Фамилия Секлетина — редкий случай, когда в основе фамилии лежит не имя, не профессия и не прозвище, а календарное женское имя, причём в просторечной форме. Это сразу отличает её от подавляющего большинства русских фамилий, образованных от мужских имён.

Исходное имя — Секлетея (Секлетиния). Это народная переработка церковного имени Синклитикия (греч. Synkletike — «сенаторская», «принадлежащая к совету»). В русском быту длинное и неудобное имя сократили и адаптировали: Синклитикия → Секлитинья → Секлетея. Такая трансформация типична для народной этимологии: непонятное греческое слово заменяли на более привычное «секли» (рубили) или «секла», хотя прямой связи с глаголом «сечь» нет.

Фамилия Секлетина образована по самой распространённой модели: от женского имени через суффикс -ин. Она отвечает на вопрос «чей?» и означает «дочь (или жена) Секлеты». В русской традиции фамилии на -ин часто давали по матери, если женщина была главой семьи (вдова) или если имя отца было менее употребительным. Однако в случае с Секлетиной вероятен и другой путь: так могли записать внебрачного ребёнка или человека, которого в крестьянской общине знали по матери.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — Архангельской, Вологодской, Костромской, Нижегородской областям. Именно там чаще встречались старообрядческие и простонародные имена, не принятые в дворянской среде. В южных и западных губерниях Секлетина почти не фиксируется.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии — почти наверняка крестьяне или мещане. Дворянских родов Секлетиных не существовало: имя Секлетея считалось простонародным, и в высших сословиях девочек так не называли. Фамилия не имеет вариантов с суффиксом -ов (Секлетов) — это дополнительно указывает на её «материнское» происхождение, поскольку -ов типичен для фамилий от мужских имён.

В современной России фамилия остаётся редкой. Её носители могут встретиться в Поволжье и на Урале, куда переселялись крестьяне из северных губерний. При этом сама основа — имя Секлетея — почти вышла из употребления, так что фамилия стала «застывшей» формой, хранящей память о забытом женском имени.