Фамилия Селенгинский — редкий случай, когда географическая основа очевидна, но её связь с конкретным человеком не так прямолинейна, как кажется. Это типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + суффикс -ск- + окончание -ий». Такие фамилии в России чаще всего давались не крестьянам, а людям, имевшим отношение к административной или церковной службе: дворянам, священникам, чиновникам, военным.

Основа фамилии — река Селенга, крупнейший приток Байкала, протекающая по территории Бурятии и Монголии. От неё же получил название город Селенгинск (основан в 1665 году как острог, позднее уездный город Иркутской губернии) и Селенгинский уезд. Человек, получивший фамилию Селенгинский, скорее всего, не был уроженцем этих мест, а либо служил там, либо вышел из духовного сословия: выпускники семинарий часто брали фамилии по названию епархии, монастыря или прихода.

В отличие от «рядовых» фамилий на -ов/-ев, которые возникали стихийно из прозвищ или отчества, фамилии на -ский в XVIII–XIX веках нередко присваивались искусственно. В среде русского духовенства это был массовый процесс: будущий священник, оканчивая семинарию, мог взять фамилию по месту своего рождения или службы. Так, сын священника из Селенгинского уезда или сам служитель храма в Селенгинске вполне мог стать Селенгинским. Другая, менее вероятная версия — происхождение от потомков ссыльных или служилых людей, закрепивших за собой прозвище «Селенгинский» по месту долгой ссылки или службы, но для дворянских родов такая фамилия нетипична.

Фамилия не массовая. Встречается в основном в Сибири и на Дальнем Востоке, а также в центральных регионах России — вероятно, потомки тех, кто уехал из Забайкалья. Носители фамилии — не обязательно потомки бурят или монголов, несмотря на бурятское название реки (от эвенкийского «сэлэнгэ» — «железная»). Словообразовательная модель чисто русская, и фамилия эта — скорее маркер социального происхождения (духовенство или служилое сословие), чем этнической принадлежности.