Фамилия Селенкина — женская форма, а её мужской вариант — Селенкин. Она образована по простой и распространённой модели: к основе добавлялся суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Селенкин», то есть сын или потомок Селенки. Основа же — слово «селенок», которое в диалектах русского языка означало дикого гуся, казарку. Такое прозвище мог получить либо охотник, хорошо знающий повадки птицы, либо человек, внешне или по характеру напоминавший эту осторожную, но крикливую птицу.

Интересная деталь: в некоторых северных и сибирских говорах «селенком» называли не просто гуся, а конкретно молодого гуся-селезня. Это придаёт фамилии оттенок прозвища, данного скорее подростку или невысокому, юркому парню, чем взрослому мужчине. Если же отталкиваться от более редкого значения — «селенок» как «болотистое место, поросшее осокой», — то прозвище могло относиться к жителю у такой местности. Но версия с птицей встречается в ономастических источниках чаще и считается основной.

Фамилия редкая, не входит в сотни самых распространённых. Наибольшую концентрацию носителей можно проследить по данным переписей в Вятской губернии и в некоторых районах Сибири — местах, где охота на водоплавающую дичь была промыслом. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Селенкина, но это скорее результат орфографической ошибки, чем отдельная ветвь. Мужская форма — Селенкин — в русском языке склоняется как обычное притяжательное прилагательное, а женская — Селенкина — неизменяема по родам, только по падежам.