Фамилия Селенгин — редкий случай, когда географическое название перешло в фамилию напрямую, почти без изменений. В основе лежит название реки Селенги, крупнейшего притока Байкала, протекающей по территории Монголии и Бурятии. Модель образования проста: топоним (Селенг-) плюс типичный русский суффикс принадлежности -ин, указывающий на связь с местом или рекой. Такой способ характерен для фамилий, которые давали переселенцам или служилым людям по месту их прежнего жительства.

Однако здесь есть важный нюанс. Суффикс -ин в русской ономастике чаще указывает на происхождение от отца или матери (Иван — Иванов, Мария — Марьин). Но в случае «Селенгин» мы имеем дело не с личным именем, а с названием реки. Это значит, что фамилия могла возникнуть в среде землепроходцев и казаков, осваивавших Забайкалье в XVII–XVIII веках. Человек, поселившийся на берегах Селенги или вернувшийся оттуда, получал прозвище «Селенга», а его потомки уже записывались как Селенгины.

Ещё одна версия, менее вероятная, но допустимая: фамилия могла произойти от прозвища «Селенга», данного человеку за связь с этим регионом — например, за торговлю с бурятами или долгую службу в Селенгинском остроге. В любом случае, корень однозначно указывает на географию Восточной Сибири, а не на личное имя.

Фамилия редкая, в списках дворянских родов не встречается — скорее всего, она крестьянская или казачья. Её носители исторически могли быть связаны с Селенгинским казачьим войском или крестьянами, переселенными за Байкал. В современной России фамилия сохранила локальный характер: чаще всего её можно встретить в Бурятии, Забайкальском крае и Иркутской области.

С точки зрения словообразования, Селенгин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Иртышов, Амурский или Ленский, но отличается от них простотой и прямотой: без уменьшительных суффиксов и дополнительных приставок. Это делает её особенно ценной для историков — она буквально «привязана» к карте, и по ней можно восстановить маршруты миграции русских на восток.