Фамилия Селенина образована от прозвища Селеня, и здесь есть две основные версии происхождения. Первая связывает основу с глаголом «селить» — то есть обзаводиться домом, хозяйством, поселяться и обживаться на новом месте по своей воле. В этом случае прозвище Селеня получал житель села, человек, который осел на земле и вел оседлый образ жизни. Модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность, отвечая на вопрос «чей?», то есть Селенина — дочь или жена Селени, а изначально — «из семьи Селени».

Вторая гипотеза ведет к имени Селифан, которое в некоторых говорах звучало как Селяхан или Селеня — согласная «ф» в просторечии часто менялась на «х» или вовсе выпадала. Селифан — это русская просторечная форма христианского имени Сильван, восходящего к латинскому «сильва» — «лес». Это имя носил бог Сильван из римской мифологии. Интересно, что Сильван первоначально был божеством лесов и дикой природы, отождествлялся с греческим Паном и не имел официального культа в период Римской республики. Но в эпоху империи он стал самым популярным богом плебеев и рабов — покровителем культурного земледелия, хранителем дома, усадьбы и ее границ. Ему посвящали рощи, его благодарили за исцеление, удачу и освобождение от рабства, а в надписях часто упоминаются посланные им сны и видения.

Культ Сильвана был сложным и социально окрашенным. Он как бы воплощал протест простого народа против морали высших классов, которые причисляли его к «черни земных богов» и трактовали как мятежника. При этом в западных провинциях с ним отождествлялись местные боги сходного характера, что делало культ чрезвычайно распространенным. Крестьяне воздвигали ему святилища своим трудом, приносили в дар лесные участки, фонтаны, сосуды и статуи бога, изображавшегося в крестьянской одежде с серпом, плодами, деревом, собакой, козой и змеей — хранительницей дома.

Какая версия правдоподобнее? Для фамилии Селенина более вероятна связь с глаголом «селить» — это проще и естественнее для прозвища, которое давали по месту жительства или характеру человека. Версия с именем Сильван возможна, но требует допущения о нескольких фонетических переходах, что делает ее менее убедительной для массовой фамилии. Однако и она имеет право на существование, особенно если учесть, что имя Селифан действительно бытовало в русской среде.

Сам суффикс -ин указывает на древность фамилии: такие фамилии чаще всего закреплялись в северных и центральных русских землях. Потомок человека по прозвищу Селеня со временем получал фамилию Селенина, и в ней сохранилась память о предке — либо о том, кто поселился на новом месте, либо о человеке, носившем редкое церковное имя с античными корнями.