Фамилия Селькин напрямую связана с крестильным именем Сильван. В переводе с латинского (silva — «лес») оно означало «лесной» или «лесистый». Это имя давали в честь древнеримского божества Сильвана, покровителя лесов и полей. В русской народной среде полное церковное имя быстро сокращалось до обиходных форм, и одна из них — Селька — и легла в основу фамилии.

Модель образования здесь классическая для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я. Такой способ использовали, когда говорили о принадлежности человеку: Селькин буквально значит «сын Сельки» или «человек из семьи Сельки». По тому же принципу появились Панькин от Панька, Васькин от Васька. Фамилию могли дать и не по прямой линии, а через главу семьи — например, детям или домочадцам.

Интересно, что имя Сильван в русских святцах встречалось нечасто, поэтому и производные от него фамилии заметно реже, чем, скажем, Ивановы или Петровы. Селькин — фамилия редкая, и это делает её более локальной: она сильнее привязана к конкретным родам и местностям. Встречаются и однокоренные варианты — Сильванов, Сильванский, а также Сельков, где основа та же, но суффикс другой.

Версия о происхождении от имени Сильван — основная и наиболее правдоподобная. Есть и более прозаическое объяснение: в некоторых говорах «селькой» могли называть жительницу села или крестьянку, но такое прозвище для мужчины маловероятно. Поэтому лингвисты и ономасты сходятся на том, что в основе лежит именно мужское имя, а не нарицательное слово.