Фамилия Селюнине — редкий пример, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с укладом жизни. Если отбросить типичное для северных и некоторых центральных областей России окончание -ин, указывающее на принадлежность («чей?» — сын Селюни), то корнем оказывается «селюн». Самое вероятное объяснение этого слова — «сельский житель», «крестьянин», «деревенщина». В говорах так могли назвать человека, который перебрался в город, но сохранил деревенские привычки, или, наоборот, того, кто никогда не покидал родной земли.

Словообразовательная модель здесь проста, но нестандартна. Обычно фамилии от названий местности образуются с суффиксом -ский (например, Сельский). В случае с Селюнине мы видим суффикс -ин, который в этом контексте работает как патронимический, но прикреплён не к крестильному имени, а к прозвищу. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где прозвища были основным способом идентификации — скорее всего, среди крестьян или посадских людей, а не дворянства.

Интересна и форма множественного числа — Селюнине. В русской ономастике окончание «-е» (вместо стандартного «-ы») — верный признак того, что фамилия возникла на севере или в Сибири, куда переселились поморы и жители Новгородских земель. Там было принято называть семью или род в целом: «Чьи вы?» — «Селюнине», то есть люди из рода Селюни. Это не «фамилия одного человека», а фамилия-родовое прозвище.

Версия о связи с диалектным «селюга» (неповоротливый, медлительный человек) или с глаголом «селить» (селиться, обживать место) менее вероятна, но не исключена. Однако первая — самая логичная и подтверждается географией: носители фамилии встречаются в Вологодской, Архангельской областях, в бывших новгородских колониях. Таким образом, предки современных Селюнине — это, скорее всего, коренные крестьяне-старожилы Русского Севера, которых отличали по их деревенскому происхождению.