Фамилия Семеликов — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с бытовой или хозяйственной деталью. Если отбросить суффикс -ов (указывающий на принадлежность: «чей?» — Семеликов), то остаётся корень Семел-. Здесь есть две версии, и обе заслуживают внимания.

Первая и самая прямая версия: прозвище Семеля или Семелик могли дать человеку, который занимался посевом, торговал семенами или славился своим урожаем. В южных и центральных губерниях России слово «семеля» в диалектах означало «семя», «семечко» (обычно подсолнечника). Так могли прозвать крестьянина, который первым в округе начал сеять подсолнечник на масло, или просто запасливого хозяина, собиравшего лучшие семена. Фамилия тогда оказывается «профессиональной» в самом широком смысле — не по ремеслу, а по занятию.

Вторая версия — уменьшительная форма от имени Семён. В русской народной традиции имя Семён (от древнееврейского Шимон — «услышанный Богом») давало множество производных: Сема, Семка, Семушка. Форма Семелик могла возникнуть в говорах, где «ик» выступал как ласкательный суффикс (сравните: Ваня — Ванелик, Петя — Петелик). Тогда Семеликов — буквально «сын маленького Семёна». Эта версия проще и статистически вероятнее: большинство русских фамилий на -ов образовано от крестильных имён. Однако необычный суффикс «-елик» встречается редко, что делает фамилию локальной, «говорящей» для определённой местности.

Географически фамилия Семеликов тяготеет к югу России — Ростовской, Волгоградской областям, Краснодарскому краю. Это косвенно подтверждает первую версию: именно в этих регионах подсолнечник и бахчевые культуры (арбузы, дыни) традиционно выращивали на семена, и прозвище, связанное с «семечками», было бы уместно. В центральных же областях, где имя Семён было распространено повсеместно, чаще встречаются фамилии Семёнов, Семин, Семушкин, а не Семеликов.

В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна по русским фамилиям) форма с суффиксом -елик не выделяется как типичная, что говорит о её нестандартном происхождении. Скорее всего, фамилия Семеликов — не массовая, а «гнездовая», возникшая в одном селе или группе сёл. Предок носителя такой фамилии был либо заметным огородником или торговцем семенами, либо просто человеком по имени Семён, которого в семье ласково называли Семеликом.