Фамилия Семенютин — редкий случай, когда суффикс может сказать о происхождении больше, чем корень. Корень здесь очевиден: это форма имени Семён (каноническое Симеон, от древнееврейского ‘услышанный Богом’). Но если бы фамилия была образована по самой частотной модели, мы бы имели Семёнов или Семёнин. Вместо этого мы видим суффикс -ютин.

В русской ономастике суффикс -ютин встречается нечасто. Чаще всего он указывает на то, что фамилия образована от уличного прозвища или обиходной формы имени, а не от полного имени. Семенютин — это не «сын Семёна», а скорее «сын Семенюти», то есть человека, которого в быту называли уменьшительно-пренебрежительно Семенюта. Такие формы были типичны для северных и северо-восточных говоров (Вологодчина, Архангельская область, Вятка), где любили суффиксы -юта, -юха, -юня. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть не просто Семёном, а тем, кого в деревне звали Семенюта — возможно, младшим в семье или человеком с заметной чертой характера.

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых говорах слово «семенюта» могло быть не личным именем, а прозвищем, образованным от глагола «семенить» — ходить мелкими, частыми шагами. Если это так, то фамилия могла закрепиться за человеком с характерной походкой. Однако, учитывая, что имя Семён было одним из самых распространённых в крестьянской среде, первая версия — от имени-основы — выглядит убедительнее.

Географически фамилия Семенютин тяготеет к Русскому Северу и Уралу. В дореволюционных переписях она чаще всего встречается в Вологодской и Вятской губерниях, а также в Пермском крае. Это косвенно подтверждает версию о северном диалектном происхождении суффикса. Сословно носители фамилии были почти исключительно крестьянами или мещанами — дворянских родов Семенютиных в истории не зафиксировано.

С точки зрения словообразования, фамилия Семенютин стоит в одном ряду с редкими вариантами вроде Иванютин, Гаврилютин или Миняютин. Все они образованы по одной модели: основа (краткая форма имени) + суффикс -ют(а) + притяжательный суффикс -ин. Такая конструкция — верный признак того, что фамилия сформировалась не в книжной среде, а в живой народной речи, и сохранила местный колорит.