Фамилия Семиженко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в Украине, означает «сын» или «потомок»: Семиженко — буквально «сын Семижана» или «потомок того, кого звали Семижан». В основе фамилии лежит дохристианское личное имя или прозвище Семижан, которое, в свою очередь, образовано от числительного «семь» и, вероятно, корня «жан» (от «жать» — сжимать, давить, или от «жнива» — жатва). Таким образом, Семижан могло означать человека, который работал на семи полях, владел семью участками земли или же был рождён в семье, где было семь детей.

Впрочем, есть и другая версия, менее прозрачная, но имеющая право на существование. Некоторые ономасты связывают основу «Семиж-» с диалектным словом «семиж» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли растение, похожее на дикий лук или чеснок. В этом случае прозвище Семижан могло закрепиться за человеком с резким запахом, за травником или за тем, кто торговал зеленью. Однако первая версия — числовая и земледельческая — выглядит более убедительно, поскольку числительные в основе фамилий (Шестак, Семериков, Восьмаков) встречаются часто и обычно указывают на порядок рождения или количество чего-либо.

Фамилия Семиженко распространена преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также на Кубани, куда переселялись украинские казаки. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках носители фамилии встречаются в Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерниях. Социальный состав предков — в основном казаки и крестьяне, реже мещане. Редкий суффикс -жан- в основе отличает эту фамилию от более частых Семененко или Семиренко: Семиженко не так широко известна, но её звучание сохраняет архаичную черту украинской антропонимии — связь с личным именем, которое уже не употребляется.