Фамилия Сенечкин образована по классической русской модели с суффиксом -ин, который в большинстве случаев указывает на принадлежность: «чей?» — сын Сенечки. В основе лежит имя Сенечка — уменьшительно-ласкательная форма от Семён. Семён — русская версия древнееврейского имени Шимон (Симеон), означающего «услышанный Богом». Таким образом, Сенечкин буквально переводится как «потомок Сенечки», то есть маленького Семёна.

В ономастике такие фамилии относят к патронимическим, то есть образованным от личного имени отца. Суффикс -ин типичен для фамилий, основа которых оканчивается на -а или -я: Сенечка — Сенечкин. Если бы основой была полная форма Семён, мы бы получили Семёнов. Выбор уменьшительной формы для фамилии — не редкость: так подчёркивалось, что предка в быту звали ласково, а не официально. Сравните с однокоренными фамилиями: Семёнов, Сёмин, Семин, Сенечков (от Сенечко — украинская или южнорусская форма).

Географически фамилия Сенечкин встречается в основном в центральных и поволжских областях России, а также в бывших русских поселениях на Украине. В дореволюционных переписях её носители чаще всего были крестьянами или мещанами — фамилии на -ин с уменьшительной основой особенно характерны для сельской среды, где прозвища и домашние имена передавались по наследству. Дворянских родов с такой фамилией, судя по родословным книгам, не зафиксировано.

Интересная деталь: в некоторых говорах «сенечка» могло быть и прозвищным именем, не связанным с Семёном. В диалектах русского языка слово «сеня» иногда означало «соня», «ротозей» или даже «простак». Однако для фамилии Сенечкин эта версия маловероятна: прозвища с таким значением обычно давали взрослым и образовывали фамилии через суффикс -ов (Сеняков, Сенюков), а не через -ин от уменьшительной формы. Поэтому основная и единственная правдоподобная версия — от имени Семён через форму Сенечка.