Фамилия Сенигова — яркий пример того, как один суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Здесь работает суффикс -ов-, но с характерным для северных и северо-восточных русских говоров переходом: Сенигов вместо ожидаемого Сеников. Это не опечатка и не искажение, а живой диалектный признак. В тех краях, где «г» произносили как фрикативный звук (как в украинском или южнорусском), фамилии на -гов (Балашов — Балашёв, Родионов — Родионов) могли писаться и звучать иначе, но в основе Сенигова — именно твёрдый суффикс принадлежности, указывающий на «сына Сениги».

Корень Сениг- восходит к прозвищу или имени Сенига. Это уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Семён (древнееврейское Шимон — «услышанный Богом»). В русских говорах Семёна могли называть Сеней, а от Сени образовывали вторичные формы: Сенига (с суффиксом -иг-, характерным для просторечных, неофициальных имён). Такая модель — Семён → Сеня → Сенига — типична для XVI–XVII веков, когда фамилии только закреплялись. Сенигой могли звать не только самого Семёна, но и его сына или внука, а фамилия закрепилась за потомками.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным словом сенига или сенюга (от «сени» — холодные прихожие, хозяйственные постройки). В некоторых говорах так могли прозвать человека, который жил в пристройке или работал при сенях (дворовый слуга). Однако эта гипотеза слабее: слово сенига не фиксируется в словарях как устойчивое прозвище, а имя Сенига известно по историческим документам.

Фамилия Сенигова — женская форма, по мужской линии — Сенигов. Географически она тяготеет к северным областям России (Архангельская, Вологодская), где суффикс -ов произносился твёрдо и где имя Семён было одним из самых распространённых. Встречается и в центральных регионах, но реже. Сословно предки Сениговых, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — фамилия образована от полного, а не от усечённого имени, что указывает на относительно позднее оформление (не ранее XVII века). Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах не значится.

Однокоренные фамилии — Сенин, Сенюков, Сеничев, Сениговский — все восходят к тому же имени Семён, но через разные суффиксы. Сенигова выделяется среди них именно редким формантом -иг-, который в русской антропонимии встречается нечасто (сравните: Кулига — от Кузьмы, Палига — от Павла). Это делает фамилию не просто «сыном Семёна», а «сыном того, кого в семье звали Сенигой», с оттенком ласки или бытовой привычки.