Фамилия Серкутева — редкий случай, когда основа слова почти наверняка не славянская, а прибалтийско-финская. В центральной России такие фамилии встречаются редко, и их происхождение часто связано с северо-западными землями.

Разберём словообразовательную модель. Фамилия образована с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ев, который присоединили к основе Серкут. Суффикс указывает на отчество: Серкутев — сын Серкута. Женская форма Серкутева — это вариант жены или дочери Серкутева.

Корень «Серкут» не имеет ясного славянского значения. В русских говорах нет слова «серкут» или «серкута». Самая правдоподобная версия — происхождение от карельского или вепсского прозвища. В карельском языке есть слово «särkky» (боль, ломота) или «särki» (плотва, рыба). Однако ближе к фамилии стоит вепсское «särk» (ёрш, колючая рыба) и суффикс -ut, который в прибалтийско-финских языках образует уменьшительные или прозвищные формы. То есть «Серкут» могло означать «маленький ёрш» или, в переносном смысле, «колючий, неуживчивый человек».

Менее вероятна, но возможна версия от личного имени Сергей через диалектное сокращение. В некоторых северных говорах имя Сергей могли редуцировать до «Серкута» (Сергей — Сергун — Серкут). Но эта цепочка менее естественна, чем финно-угорский корень, потому что суффикс -ут для русского имени Сергей нехарактерен.

Географически фамилия тяготеет к территории бывшей Олонецкой губернии, Карелии и Вологодской области. Именно там активно смешивалось русское и прибалтийско-финское население, и прозвища с финской основой легко встраивались в русскую фамильную модель. Предки носителей фамилии Серкутева, скорее всего, были крестьянами или рыбаками из этих мест, а их прозвище дали за характер или внешность.

Поскольку фамилия очень редкая, в официальных справочниках она не зафиксирована. В дореволюционных метрических книгах единичные записи встречаются в Вытегорском уезде и окрестностях Петрозаводска. Никаких известных исторических деятелей с такой фамилией нет.