Фамилия Сешко в большинстве случаев — это украинская фамилия, образованная от разговорной формы крестильного имени Сергей. Цепочка преобразований выглядит так: Сергей — Сережа — Серж — Серш — Сеша. Суффикс -ко, характерный для украинских фамилий, добавляет значение «сын» или «потомок», поэтому Сешко буквально понимается как «сын Сеши». Имя Сергей восходит к римскому родовому имени Сергиус, которое переводят как «высокий», «высокочтимый», «почтенный», «ясный». На Русь это имя пришло из Византии в период христианизации, и его просторечные формы дали жизнь множеству фамилий, но вариант Сешко встречается реже, чем, например, Сергеев или Сердюк.

Существует и вторая, менее распространенная версия происхождения. Согласно ей, фамилия восходит к фонетическому варианту слова «сишка» — так в некоторых говорах называли соху, пахотное орудие. В этом случае родоначальник Сешко мог быть земледельцем или ремесленником, изготавливавшим крестьянский инвентарь. Интересно, что сишкой также называли подставку-опору при стрельбе из винтовки или пулемета, что позволяет предположить связь предка с военным делом, например, артиллерией. Однако эта версия выглядит менее убедительной: имя Сергей было широко распространено, и его уменьшительные формы естественным образом становились основами фамилий, тогда как прозвище от термина «сишка» носило бы более узкий локальный характер.

Выбор между версиями зависит от региона бытования фамилии. На Украине и в южнорусских областях, где фамилии на -ко особенно частотны, версия с именем Сергей практически не вызывает сомнений. Форма Сеша как производная от Сергея зафиксирована в народной традиции имянаречения, и именно она стала основой фамилии. Если же искать следы в северных говорах, где соху называли сишкой, то там фамилия могла возникнуть независимо, но такие случаи единичны. В любом случае, фамилия Сешко — это пример того, как личное имя или прозвище, пройдя через суффиксальную модель, закрепилось за родом и сохранило память о предке — то ли о человеке, носившем имя Сергей, то ли о мастере, чей труд был связан с землей или оружием.