Фамилия Сетоян — почти стопроцентный маркер армянского происхождения. Типичный армянский патроним, образованный суффиксом -ян, который в русской передаче закрепился как -ян (в оригинале — յան). Этот суффикс в армянской ономастике играет ту же роль, что русские -ов/-ев или -ин: он указывает на принадлежность к роду, буквально «из семьи такого-то». Исчезновение конечного -ц в русском написании — норма при адаптации: армянская фамилия могла звучать как Сетоянц, но на слух и при записи в документах окончание часто редуцировалось.

Основа фамилии — мужское личное имя Сет. Это библейское имя, восходящее к еврейскому Шет (Сиф, третий сын Адама и Евы). В армянской традиции имя Сет (иногда Сед, Сетрак) было распространено, и от него образовались фамилии Сетян, Сетоян, Сетракян. Таким образом, Сетоян — «потомок Сета». Важно не путать с фамилией Седракян или Седраки: хотя корни близки, Сетоян — более прямая и краткая форма от имени Сет.

С точки зрения географии, фамилия типична для западных армян, то есть выходцев из исторической Западной Армении (ныне восток Турции). После геноцида 1915 года носители фамилии расселились по всему миру, но компактные группы встречаются в Армении, России, Ливане, Сирии и в диаспорах США и Франции. В России фамилия редкая, сосредоточена в Краснодарском и Ставропольском краях, Ростовской области — там, где исторически селились армянские переселенцы.

Интересная деталь: в некоторых говорах армянского языка имя Сет могло произноситься как Сед, поэтому не исключено, что часть носителей фамилии Сетоян — это потомки людей, чьё имя в документах записали через «т», хотя в устной речи оно звучало мягче. В любом случае, фамилия однозначно указывает на древнее библейское имя, а не на профессию или прозвище.