Фамилия Сейтимова — женская форма фамилии Сейтимов, и её происхождение напрямую связано с этнической и языковой историей тюркских народов. В основе фамилии лежит мужское имя Сейтим, которое представляет собой сложносоставное тюркское имя. Первая часть, «Сей-», скорее всего, восходит к арабскому «сайид» (господин, потомок пророка) — это очень распространённый компонент в мусульманских именах у казахов, киргизов, башкир и татар. Вторая часть, «-тим», — это притяжательный аффикс, означающий «мой» (например, «мой верблюд», «мой друг»). Таким образом, имя Сейтим можно перевести как «мой господин» или «мой сейид» — форма, выражающая почтение и близость.

Суффикс -ов/-ев в фамилии Сейтимов — типичный русский патронимический формант, который добавили к тюркскому имени при оформлении фамилий в XIX–XX веках. Такая модель — основа на тюркское имя плюс русский суффикс — характерна для многих фамилий народов Поволжья, Урала и Средней Азии, которые вошли в состав Российской империи. Мужская форма Сейтимов, а значит, и женская Сейтимова, указывает на то, что предок носителя фамилии был человеком, которого звали Сейтим. Это имя могло быть дано ребёнку в семье, где почитали религиозных авторитетов (сейидов), или же как пожелание, чтобы мальчик вырос уважаемым и влиятельным.

Географически фамилия Сейтимова наиболее распространена в Казахстане, а также среди казахов, проживающих в приграничных районах России (Оренбургская, Астраханская области). Встречается она и у киргизов. В русских архивных записях фамилия фиксируется с конца XIX века, преимущественно среди кочевого и полукочевого населения, которое при переходе к оседлости получало официальные фамилии по имени отца. Социальный статус предков, скорее всего, был связан с рядовыми скотоводами или земледельцами, хотя имя Сейтим могло указывать на принадлежность к роду, ведущему происхождение от духовных лиц.

Стоит отметить, что написание фамилии через «е» (Сейтимова), а не через «и» (Сйтимова) — не случайность. Это следствие фонетики тюркских языков, где звук «й» смягчает предшествующую гласную, а на письме передаётся буквой «е». Встречающиеся варианты Сайтимова или Саитимова — результат диалектных различий или ошибок при записи, но основная и исторически верная форма — через «е».