Фамилия Сейткасымова — женская форма фамилии Сейткасымов, и её происхождение напрямую связано с историей тюркских народов, в первую очередь казахов. В основе — сложное имя Сейткасым, которое образовано слиянием двух арабских компонентов, прочно вошедших в мусульманскую ономастику. Первая часть, «Сейт», — это вариант имени Сеид (Сайид), что означает «господин», «повелитель» или «потомок пророка Мухаммеда». Вторая часть, «Касым» (Касим), переводится как «разделяющий», «распределяющий», а также является именем одного из сыновей пророка. Таким образом, всё имя целиком можно истолковать как «господин Касым» или «потомок пророка по имени Касым», что указывает на высокий социальный статус предка.

Окончание «-ова» в русском языке превратило мужскую фамилию Сейткасымов в женскую, что типично для русификации фамилий в славянской среде. Сама же фамилия Сейткасымов образована по тюркской модели: к имени Сейткасым прибавили притяжательный аффикс «-ов» (в русской передаче), который в казахском языке часто соответствует окончанию «-ұлы» (сын) или «-қызы» (дочь). То есть Сейткасымов — буквально «сын Сейткасыма». В исконной казахской записи фамилия выглядела бы как Сейткасымұлы, но в советский период, при массовой паспортизации, её адаптировали под русскую грамматику, добавив типичное окончание.

Географически фамилия почти наверняка восходит к казахской среде. Имена с частью «Сейт» особенно распространены среди казахов, а также у других тюркских народов Центральной Азии, исповедующих ислам. Встречается она и у кыргызов, но с меньшей частотой. Скорее всего, предки носителей фамилии принадлежали к одному из казахских родов или племён, где имя Сейткасым было дано в честь уважаемого предка — аксакала или религиозного деятеля. В отличие от многих русских фамилий, образованных от прозвищ по профессии, эта фамилия — чисто патронимическая, то есть указывающая на отца, а не на род занятий.

Интересно, что в русском языке фамилия Сейткасымова не склоняется по падежам так же, как и мужской вариант, если речь идёт о женщине: «книга Сейткасымовой», «встретил Сейткасымову». Сама фамилия редкая и не входит в списки распространённых русских фамилий, что делает её носителей легко идентифицируемыми в славянском окружении. В отличие, например, от фамилии Касымов, которая встречается чаще, приставка «Сейт» сразу указывает на более конкретную родословную линию, подчёркивая, что предок носил двойное имя.