Фамилия Сейтксымов — редкий случай, когда написание почти полностью сохраняет звучание исходного тюркского имени, но с русским патронимическим суффиксом. Основа здесь — личное имя Сейтксым. В нём два корня: «Сейт» (арабское سيد, саййид — «господин», «потомок пророка», уважительный титул) и «ксым» (искажённое «касым» или «касим» — от арабского قاسم, «разделяющий», «распределяющий», одно из имён пророка Мухаммеда). Имя Сейткасым (или Сейтксым в стяжённой форме) буквально значит «господин Касым» или «почтенный Касым» — составное имя, где первая часть подчёркивает высокий статус.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий: «чей?» — Сейтксымов, то есть потомок человека по имени Сейтксым. Такая форма характерна для тюркских народов, которые в XIX–XX веках жили в составе Российской империи и получали фамилии по отцу с русским окончанием. Географически фамилия тяготеет к Казахстану, Башкортостану и Татарстану, где имена с «Сейт-» (Сейтжан, Сейтбаттал) встречаются часто. Встречается и вариант написания Сейткасымов — он ближе к литературному произношению, но Сейтксымов отражает реальное бытовое стяжение в речи.

Интересно, что вторая часть имени — «ксым» — могла в некоторых диалектах слиться с «кысым» (тюрк. «моя доля»), но это народная этимология. Научные ономастические источники, например работы по тюркской антропонимике, однозначно возводят её к арабскому Касым. Социальный контекст: предки носителя фамилии, скорее всего, не были ни кочевыми скотоводами, ни городской элитой — имя Сейтксым давали в среде, где ценились религиозные имена и уважение к потомкам пророка, то есть в мусульманских семьях со средним достатком. Фамилия не получила широкого распространения из-за сложности произношения для русского уха, но именно эта редкость делает её точным маркером происхождения из определённой локальной группы.