Фамилия Сейтшаева — одна из тех, что ясно указывает на тюркские корни, скорее всего, казахские или ногайские. Её основа — мужское имя Сейтша, которое, в свою очередь, является сложносоставным вариантом от арабского имени Сейт (Сейид, Сайид). В переводе с арабского «сайид» означает «господин», «вождь», «глава рода» — почётный титул, который в мусульманском мире давали потомкам пророка Мухаммеда. Частица «ша» в конце — это персидский компонент, означающий «царь», «шах», «владыка». Таким образом, имя Сейтша можно истолковать как «господин-царь» или «владыка из рода пророка» — форма двойного почтения, нередкая в восточной антропонимии.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русской адаптации тюркских фамилий. К основе Сейтша добавлен русский патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность: «чей?» — Сейтшаев, то есть сын (или потомок) Сейтши. Окончание -а — женский вариант фамилии, образованный по той же схеме, что и Иванова, Петрова. В мужском варианте фамилия звучит как Сейтшаев.

Географически фамилия наиболее распространена на территории Казахстана, особенно в западных и южных областях, а также среди казахской диаспоры в России (Астраханская, Оренбургская области). Встречается она и у ногайцев — народа, исторически проживающего на Северном Кавказе и в низовьях Волги. Носители фамилии, вероятно, происходят из родов, где имя Сейтша давали в честь уважаемого предка — аксакала или религиозного авторитета, что подкрепляет версию о связи с титулом «сейид».

Интересно, что фамилия Сейтшаева не имеет прямых аналогов среди славянских или западноевропейских фамилий — это яркий пример того, как арабо-персидское имя, пройдя через тюркскую среду, получило русское окончание и стало фамилией, сохранив при этом свой высокий смысловой заряд.