Фамилия Шабунька — один из тех редких случаев, когда географию происхождения можно определить почти безошибочно. Она характерна для западных областей Украины и юго-запада Беларуси, где распространены фамилии с уменьшительно-ласкательным суффиксом -к(а). По сути, Шабунька — это не что иное, как форма имени или прозвища, застывшая в родительном падеже: «чей?» — Шабунька, то есть сын или потомок Шабуня.

Корень фамилии — Шабунь. Скорее всего, это производное от имени Шабан, которое пришло в восточнославянские земли из тюркских языков. Шабан — название восьмого месяца мусульманского лунного календаря, и на Руси так нередко называли мальчиков, родившихся в это время, особенно в татарских или смешанных семьях. В белорусском и украинском говоре имя могло трансформироваться: Шабан → Шабунь (с мягким окончанием, типичным для местной фонетики) → Шабунька.

Есть и другая, менее вероятная версия: от украинского слова «шабуня» — так в некоторых говорах называли шалуна, непоседу или болтуна. Если это так, то фамилия изначально была прозвищем за характер. Однако тюркская основа выглядит убедительнее, потому что имя Шабан фиксируется в исторических документах, а Шабунька — его закономерный «внук».

С точки зрения словообразования, фамилия Шабунька стоит в одном ряду с такими восточноевропейскими фамилиями, как Дзюбунька, Казюнька, Марунька. Суффикс -к(а) здесь не уменьшительный в прямом смысле (как в «ложечка»), а патронимический, указывающий на родство. Это ставит фамилию в особый разряд: она не на -ов/-ев и не на -ин, а на -ка, что характерно для западнорусских и украинских земель, где фамилии такого типа нередко оформлялись как прозвища целого рода.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или казацким. Фамилия не дворянская и не книжная — она возникла в живой речи, в среде, где человека называли не по отцу с окончанием «-ович», а по домашнему, уличному прозвищу. Встретить Шабуньку сегодня можно в основном в Тернопольской, Хмельницкой и Ровенской областях Украины, а также в Брестской области Беларуси.