Фамилия Шафеева образована от имени Шафей, которое является диалектным вариантом арабского мужского имени Шафи, что в переводе на русский язык означает «лечащий». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын в будущем стал хорошим и добрым человеком, помогающим людям. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Шафеевых можно лишь на основании генеалогических исследований.