Фамилия Шагановская образована по распространённой в польской, украинской и белорусской ономастике модели с суффиксом -ский/-ская. Такие фамилии обычно указывали на принадлежность к месту — селу, усадьбе или географическому объекту. В основе лежит топоним Шаганово, Шагань или похожий. Подобных сел и деревень с корнем «шаган» немало на западе России, в Беларуси и на востоке Польши. Например, в Брестской области есть деревня Шаганово, а в бывшей Виленской губернии — местечко Шаги. Владелец такого поместья или выходец оттуда получал прозвище «шагановский», которое со временем закреплялось как фамилия.

Корень «шаг» или «шаган» имеет несколько версий происхождения. Самая прямая — от древнерусского слова «шаг» (поступь, движение), но в основе топонимов чаще лежит личное имя или прозвище. В старых польских и литовских метриках встречается имя-прозвище Szagan, которое могло быть вариантом тюркского «шаган» (сокол, ястреб) или уменьшительной формой от славянского имени Шаг (редкое, от глагола «шагать»). В любом случае, первым носителем фамилии был человек, связанный с местностью, названной по имени или особенности ландшафта.

Суффикс -ская — типично дворянский или шляхетский для Речи Посполитой. В XVII–XVIII веках так оформляли фамилии мелкопоместные дворяне и однодворцы, владевшие землёй. Однако со временем фамилия распространилась и среди крестьян, переселявшихся в другие губернии. В Российской империи носители Шагановских чаще всего встречались в западных губерниях — Могилёвской, Витебской, Гродненской, а также среди переселенцев на юг Украины.

Ударение в фамилии вариативно: в русской традиции чаще Шагано́вская, в польской — Szagańowska с ударением на предпоследний слог. На письме встречались варианты Шагановска, Шаганевская — из-за особенностей местных говоров и канцелярских ошибок. Редкая фамилия, не имеющая массового распространения, что указывает на происхождение из одного локального гнезда.

Однокоренные фамилии — Шаганов, Шаганович, Шаганский — все они восходят к тому же корню, но образованы по разным моделям. Шагановская — самая географически привязанная: она прямо говорит, что предки жили или владели землёй в Шаганове.