Фамилия Шакотько — яркий пример восточнославянской фамилии, образованной по модели, характерной для украинской и белорусской ономастики. Её основа — прозвище Шакоть, а суффикс -ко (уменьшительно-ласкательный или патронимический) указывает на то, что фамилия могла означать «потомок Шакоти» или «маленький Шакоть». Такая модель (основа + -ко) очень распространена в Украине и на юго-западе Беларуси, поэтому географически фамилию стоит связывать прежде всего с этими регионами.

Корень шакот- в славянских языках связан с глаголом «шакотать» — так в некоторых говорах называли стрекот сороки или вообще резкий, дробный звук. Человек с таким прозвищем мог быть говорливым, суетливым или издавать характерные звуки (например, цокать языком). Встречается и более прозаичная версия: в польском языке «szakotać» означало «стучать, греметь», поэтому прозвище могли дать шумному ремесленнику — кузнецу, бондарю или мельнику.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Фамилии Шакот (встречается в Беларуси) и Шакотко (с тем же суффиксом) — прямые родственники, различающиеся только оформлением. А вот фамилия Шаков (на -ов) — результат русификации той же основы, что подтверждает: Шакотько сохранила более архаичную, «неокняжескую» форму, не адаптированную под великорусскую модель на -ов/-ев.

О сословном происхождении носителей фамилии можно судить по модели: суффикс -ко в XVI–XVII веках был типичен для казацкой старшины, мещан и крестьян, но не для боярства. В реестрах запорожских казаков встречаются фамилии на -ко (Кулишко, Шапотько), что позволяет осторожно предположить: предки Шакотько могли быть казаками или вольными поселенцами. Однако точных исторических документов о конкретных носителях фамилии в открытых источниках мало — это редкая фамилия, не попавшая в крупные генеалогические справочники.

Современное написание через о (Шакотько) — результат фонетического процесса: в безударном положении «а» могло перейти в «о» под влиянием акающих говоров или при записи фамилии в русскоязычных документах. В украинском варианте фамилия могла бы писаться как Шакотько (с чётким «а»), но в русском контексте закрепился вариант с «о».